主後1998年4月12日為設教52週年,同日舉行第五任盧俊義牧師就任禮拜,於同年7月1日開始推動查經班,為了使不同需求的會友都有參加的機會,共開兩班分別於每禮拜三早上9:30起及禮拜五晚上7:30起,目前平均出席人數皆達180人以上,同時也開始了婦女查經班及社青查經班。為了更落實推動讀經,於1999年1月3日開始同時推動「讀聖 經寫作業」,並在週報刊登「聖經導讀」內容供會友參考,於2001年5月31日讀完新舊約聖經一遍。同年7月1日開始第二次讀聖經。此外,也在每年暑期推動「快樂兒童營」,堅持只教導聖經的內容,並且不收費用。第一年(1998年)舉辦時平均每日有82位小朋友出席,第二次 舉辦(於2000年)平均出席人數則增加到119位,2001年則平均有178位以上的小朋友來參加。今年(2010年)目標為300人,並邀請弱小教會一同參與。至於傳福音的事工則從開拓教會轉變為支援弱小的教會及非洲宣教事工,目前協助的教會或是宣教事工共有8個單位。
2001年是設教五十五週年,於3月份開辦了東門學苑,共有四門學科,分別為「聖經與現代人」、「藝術欣賞」、「心靈與健康」、「綠色生活」,總計62名學員,第一學期已經在6月28日告一段落,並於9月4日開辦第二學期。東門學苑至今走過10個年頭,一樣維持四門課程:心靈與健康、科技與現代人生活、營造健康人生與台灣近代歷史與人物,學員數也增加到接近200人。為了慶祝設教55週年,今年3月10-11日在石門水庫芝麻酒店舉辦了全教會的生活營,共計285名會友參加,是首次全教會會友的活動,蒙主賜福讓我們很順利平安的完成了這樣大型的營會。
東門教會期望能成為一個人人熱愛讀經的教會,更希望能成為推廣讀經的中心,因為我們相信教會是建造於聖經-上帝的話的基礎上面,也盼望教會能明白上帝的話順從上帝的話,來成為這個時代、這個社會的光燈。